生物信息常用30个Linux命令(一) 生物信息常用30个Linux命令(二) 21、df df: disk free df用于查看磁盘消耗,显示磁盘可用空间数目信息及空间结点信息。一般加一个-h选项,然后接要查看的磁盘,默认所有磁盘。 -a 显示全部文件系统 -h 文件大小友好显示 -l 只显示本地文件系统 -i 显示inode信息 -T 显示文件系统类型 $ df -h 22、du du: Disk usage df用于查看磁盘大小,du用于查看目录所占磁盘大小,一般也加-h选项 -h 方便阅读的方式 -s 只显示总和的大小 $ du -sh wgs/ 23、find find顾名思义,主要用于查找文件。因为当文件越来越多的时候,由于Linux是文本界面,不方便可视化文件,这个时候就可以利用find快速找到需要的文件。find支持多种搜索方式。
24、which which 可执行文件名称 | 查看可执行文件的位置,在PATH变量指定的路径中查看系统命令是否存在及其位置 #案例一:搜索Data目录下以点fna结尾的文件; 25、top top可以动态显示系统进程使用情况,类似于windows系统的任务管理器。可以 显示当前系统正在执行的进程的相关信息,包括进程ID、内存占用率、CPU占用率等。 $ top 26、ps ps: process status ps也是系统进程管理工具,与top不同的事,top可以动态显示,而ps则是静态显示,是某一时刻的快照,静态显示的好处是便于其他程序捕获结果,进行处理。 a 显示所有的进程 -a 显示同一终端下的所有程序 e 显示环境变量 f 显示进程间的关系 -H 显示树状结构 r 显示当前终端的程序 T 显示当前终端的所有程序 -au 显示更详细的信息 -aux 显示所有包含其他使用者的行程 -u 指定用户的所有进程 $ ps -aux 27、kill kill的作用是杀死进程,给定一个任务的ID号,可以通过top或者ps命令获得,例如当前有一个sleep进程,pid号为12000;通过kill -9可以强制杀死。 $ kill -9 12000 28、chmod chmod: Change mode 用于修改文件权限,Linux基础怒权限可以包括ugo模式以及421模式。 #原始权限 与之类似的还有chown与chgrp; chown: Change owner chgrp: Change group 29、passwd passwd 修改密码,Linux密码要求大写字母开头,包含字母与数字组合,不能过于简单。 -l 使密码失效 -u 与-l相对,用户解锁 -S 列出登陆用户passwd文件内的相关参数 -n 后面接天数,shadow 的第 4 字段,多久不可修改密码天数 -x 后面接天数,shadow 的第 5 字段,多久内必须要更动密码 -w 后面接天数,shadow 的第 6 字段,密码过期前的警告天数 -i 后面接『日期』,shadow 的第 7 字段,密码失效日期 $ passwd 30、exit 退出登录,不要小看这个exit,exit是正确退出,最好不要直接点windows关闭窗口按钮退出,也不要使用ctrl+D给定退出信号退出。 总结 以上只是学习生物信息的基本掌握的一些命令,已经可以完成绝大部分的工作了,当然,技不压身,如果掌握更多的命令可以更好的完成工作。 ---------- END ---------- (可以添加作者微信,备注好单位+姓名) 您可能还会感兴趣的 手把手教你生信分析平台搭建专栏合集 生物信息重要资源站点合集 Perl还是Python或者R 绘制manhanttan图 利用R绘制GO条目图 如何在Linux下优雅的装X 利用R实现vlookup 生物学才是终极学科 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 我们尊重原创,也注重分享,文章来源于微信公众号:分析不凉,建议关注公众号查看原文。如若侵权请联系qter@qter.org。 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- |